...UCSC Xena接口,可以获取一些UCSC Xena存储的信息,包括GDC、TCGA、ICGC、GTEx、CCLE等数据库的上千个数据集。特别是TCGA(hg19版本)的一部分数据UCSC做了非常好的标准化处理,下载即可用。这几天我想要能够通过代码下载相关数据,...
简易TCGA下载工具 能否下载TCGA里面control数据?
今天2018-10-27新安装的v14版本的 TCGA下载工具,无法连接TCGA数据库,请问怎么办? 补充:我使用sangerbox中生信人V-p-N。是不是需要自己购买其他的科学上网工具才行?
TCGA简易下载工具 缺少TCGA-COAD数据集
...理过的东西也发一发。截止2018年GDC的最新一次更新后,TCGA现存数据大致如下:CNVFPKM/FPKM-UQmiRNA isoformclinical甲基化450KAcute Myeloid Leukemia(TARGET-AML)急性髓系白血病285151105200140Acute Myeloid Leukemia(TCGA-LAML)急性髓系白血...
TCGA=matrix(as.numeric(as.matrix(GeneExp)),nrow=nrow(GeneExp),dimnames=list(rownames(GeneExp),colnames(GeneExp)))> TCGA=averegs(TCGA)Error in averegs(TCGA) : 没有"averegs"这个函数>
祝老师,您好!之前的问题已经解决,谢谢您的解答。再打扰您问一下,一个样本有3个数据,编号分别为TCGA-44-6775-01,TCGA-44-6775-01_Rep307,TCGA-44-6775-01_Rep376这是什么情况?
TCGA建议下载工具找不到TCGA-CESC、COAD等多个数据集,请问是什么原因呀?之前使用时可以找到TCGA-CESC、TCGA-COAD,现在无法在数据集界面看到,不知道是什么原因
就像这样,已经登陆,java和R也配置好了,谢谢大家!
TCGA简易下载工具下单HTSeq FPKM数据是 TCGA RNA-seqV2吗
请问简易TCGA下载工具的ENSG_ID转换和TCGA ID转换器的转换有什么区别吗?
癌症基因组图谱(TCGA)是一个从2005年开始的一个项目,旨在使用基因组测序和生物信息学来分析负责癌症的基因突变。 TCGA应用高通量基因组分析技术,通过更好地了解这种疾病的遗传基础,提高我们诊断,治疗和预防癌症的...