GSEA分析

使用GSEA软件对差异基因KEGG富集分析时,过滤基因集大小如何设置?(基因集最少几个成员及最多几个成员)如何理解过滤基因集?我在分析时把最少基因集设为5时能分析出结果,但设置成15时提示没有任何结果,是什么原因?attachments-2018-12-LoljSqBF5c0c07cd8798f.png

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2 个回答

Yue Yang

请问老师一个弱弱的问题,GSEA每组至少几个样本呢?

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祝让飞 - 生物信息工程师

最小基因数设定的太高,没有满足条件的通路,当然没结果了

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