20 用芯片的cdf文件对cel文件注释得到的不是探针表达矩阵,请问怎么处理?

用RMA对cel文件进行标准化的时候,报错,说没有cdf环境,然后用该芯片自带的cdf加载了以后,成功进行了RMA标准化。但是得到的矩阵第一列不是探针名字,而且矩阵的行数也比GPL平台文件提供探针数多了8倍还要多………………请问接下来要怎么处理,怎么得到探针矩阵,

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1 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师

这种芯片 需要 特定情况 特定分析了,你得到的应该是探针的表达矩阵,不过里面很多匹配不上,或者还有探针簇什么的

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  • 高小德 提出于 2020-11-11 12:43

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