3 TCGA中miRNA profiling下载完,合并后merge.txt错位

1.下载STAD数据中BCGSC miRNA profiling(491),下载成功,并能完成合并;打开merge文件,发现错位,数值矩阵和标题(样本名)错两列;

attachments-2018-01-20SWY8ro5a5d7734773ce.png

2. 其中一列数据全部为N;

attachments-2018-01-Ictd2TsQ5a5d774909446.png


3. 寻找下载的每个样本的独立文件,发现前两列也有错误,是其中一个样本的read_count和

reads_per_million_miRNA_mapped;其他列应该是没有错误,没有核对;

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不知道是哪里出了问题?求解决,谢谢!


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1 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师

因为合并时第一个文件的所有列都会保留的,所以数据才会有两列错位的情况,你删掉那两列,右侧数据往左移动就OK

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