简易批量生存分析工具！省时又省力！
省时又省力，几百个基因做生存分析，挑选对样本的生存状态有显著影响的基因，然后用这些基因进行进一步的做生存分析，绘制ROC曲线。
省时又省力，几百个基因做生存分析，挑选对样本的生存状态有显著影响的基因，然后用这些基因进行进一步的做生存分析，绘制ROC曲线。
01
—
研究背景
昨天给小伙伴们分享了使用《cox回归分析了某个基因的表达情况对样本生存状况的影响》，并绘制km曲线。
很多人私信小编说，你推广的方法挺好的，但是有个问题：
“ 比如说我们通过差异基因或者WGCNA找到了几百个基因，如果用上述的方法一个一个的做cox分析，等我做完了，师弟师妹都换好几轮了。 ”
小编想了一下，确实很有道理，就和技术小哥哥商量，开发一个能批量做生存分析的工具，这样小伙伴可以对几百个基因做生存分析，挑选对样本的生存状态有显著影响的基因，然后用这些基因进行进一步的做生存分析，绘制ROC曲线，省时又省力。
快跟着小编一起学习一下这个工具
网址导航
http://sangerbox.com/Tool 点击“简易批量生存分析工具”
02
—
使用方法
1.输入数据格式
----------
1.1__表达矩阵：行名为基因名称，列名为样本名称，如下图所示：
1.2__生存信息：共有三列，第一列为样本名称，要与表达矩阵的样本名数据一样，第二列为生存时间，第三列为生存状态，0代表存活，1代表死亡。样本信息和表达矩阵能自动匹配样本，无需手动整理样本。样本信息如下图所示：
2.设置参数
----------
3.结果目录
----------
具体指引详见：
- 发表于 2020-05-26 10:13
- 阅读 ( 2460 )
- 分类：软件工具
