孟德尔随机化之因果推断的假设(二)

‍ ‍ ‍ ‍ ‍ ‍ ‍ 3.2‍ 查找有效的工具变量 ‍‍ ‍ ‍ ‍ ‍ ‍ ‍ ‍ ‍ ‍ ‍ 工具变量(IV )技术是可用于估算因果效应的几种方法之一,而无需完全了解所有可能影响暴露- 结局??

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  • 米老鼠
  • 发布于 2020-09-13 23:22
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孟德尔随机化之因果推断的假设(一)

在前几期的内容中,我反复强调孟德尔随机化得出的是“因果”推论。在今天这一期中,我将重点阐明这种“因果推断”的含义。同时,我还将对工具变量理论进行了更详细的解释,并用生物学

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  • 米老鼠
  • 发布于 2020-09-13 23:21
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孟德尔随机化之基础概念与研究框架

在本期中,我将说明孟德尔随机化的基础概念与研究框架,并解释如何使用孟德尔随机化去解决常规流行病学问题。 2.1 什么是孟德尔随机化? 孟德尔随机化是在非实验数据中使用遗传变异

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  • 米老鼠
  • 发布于 2020-09-13 23:20
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孟德尔随机化之遗传学概述

为了理解孟德尔随机化,我们有必要对遗传学有一个粗略的了解。 1. 读取遗传密码 许多生物的遗传信息(或基因组)由长长的一串遗传密码组成,这些遗传密码以DNA(脱氧核糖核酸)的形式?

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  • 米老鼠
  • 发布于 2020-09-13 23:18
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孟德尔随机化之研究背景

久违的孟德尔随机化开始更新了,在今天的内容中,我将向大家介绍孟德尔随机化的基本概念及其背景知识,并举例说明何时可以使用该方法以及该方法为何能有效解释因果关系。本系列讲解内

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  • 米老鼠
  • 发布于 2020-09-13 23:17
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存在cdf文件的芯片数据,但没有R包构建R包并安装cdf

关键命令: BiocManager::install('makecdfenv') library(makecdfenv) make.cdf.package("GPL15048_HuRSTA_2a520709.CDF.gz", "hursta2a520709cdf", species = "Homo sapiens", compress = T...

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  • 祝让飞
  • 发布于 2020-09-04 20:28
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TIF图片太大难以上传?

压缩TIF图片到达合适的大小

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  • 柚子
  • 发布于 2020-09-02 11:36
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如何将PDF文件内容变为灰色来降低价格?

文件内容色彩变灰来维持价值

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  • 柚子
  • 发布于 2020-08-19 16:26
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4分+纯生信分析:免疫结合病毒如何实现抗肿瘤作用

大家好, 今天和大家分享的是 2020 年 4 月发表在Biomed Pharmacother(IF:4.545)上的一篇文章,作者通过网络药理学结合生物信息学方法,分析了传统中药——家蚕对于肝癌的药理机制。 标题:Study on th

文献解读(4)识别与m6A相关的mRNA Signature 来预测胰腺癌患者的预后情况

发表期刊:Mol Ther Oncolytics 发表日期:2020 Apr 29 影响因子:5.71 DOI: 10.1016/j.omto.2020.04.011

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  • 柚子
  • 发布于 2020-06-17 14:20
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读了这篇文章,你也能无代码生信分析发四分SCI

其实前段时间小编已经给大家分享了单基因泛癌分析,拿着自己研究的基因,通过Sangger box云平台就可以得到了属于自己的单基因分析报告(如果有兴趣的话可以去翻一下那篇文章) 强调:代码编程和网页小工具只是数据分析方法,重要是研究思路,如何将分析结果将生物学含义联系起来才是至关重要的点。 下面这篇文章的分析内容比小伙伴们拿到的那份分析报告内容少了很多,但是文章分数却不低,文章的题目虽然是关于胃癌的,但是作者研究的研究思路却是泛癌,值得小伙伴们借鉴。一起来看看吧!

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  • 欢乐豆
  • 发布于 2020-06-16 09:39
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文献解读(3)在AML中是否存在RNA剪切差异?

发表期刊:Clinical Cancer Research 发表日期:2020 Mar 2. 影响因子:8.91 DOI: 10.1158/1078-0432.CCR-20-0184

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  • 柚子
  • 发布于 2020-06-15 15:51
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文献解读(2)在鉴别肺腺癌患者与预后相关 immune signatures

发表期刊:Cellular Oncology 发表日期:2020 May 28 影响因子:5.52 DOI: 10.1007/s13402-020-00515-7

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  • 柚子
  • 发布于 2020-06-15 15:47
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文献解读(1)用免疫风险评分预测黑色素瘤转移的风险

发表期刊:Front Bioeng Biotechnol 发表日期:2020 Mar 31 影响因子:5.12 DOI:10.3389/fbioe.2020.00206

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  • 柚子
  • 发布于 2020-06-15 15:37
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高颜值的相关性计算工具——你爱了吗!

相关性基础知识 “ 相关表和相关图可反映两个变量之间的相互关系及其相关方向,但无法确切地表明两个变量之间相关的程度。 相关系数是用以反映变量之间相关关系密切程度的统计指标。相关系数是按积差方法计算,同样以两变量与各自平均值的离差为基础,通过两个离差相乘来反映两变量之间相关程度;着重研究线性的单相关系数 ”

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  • 柚子
  • 发布于 2020-06-15 15:25
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继“Venn图”之后的新秀“山峦图”

“Sangerbox云平台有交互式、可视化分析,无需会编程,只需将数据进行简单整理,点击鼠标,即可出图,快速便捷,很是厉害”

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  • 柚子
  • 发布于 2020-06-15 15:21
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TCGA RNA测序ID转换一文就够

“为了解决在使用TCGA数据做数据分析时各种数据转化问题,话不多说直接看教程,干货满满”

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  • 柚子
  • 发布于 2020-06-15 15:17
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超详细!三种方法来绘制Venn图

“Venn图是我们科学研究中常用的图形之一,今天小编给小伙伴们介绍三种Venn图绘制工具,小伙伴根据自己的要求进行选择,如果小伙伴觉得对你有帮助,欢迎转发与收藏。”

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  • 柚子
  • 发布于 2020-06-15 15:10
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如何解决生信新手分析时常常遇到的数据问题

参考文献 Wagner, G.P., Kin, K. & Lynch, V.J. Measurement of mRNA abundance using RNA-seq data: RPKM measure is inconsistent among samples. Theory Biosci. 131, 281–285 (2012).

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  • 柚子
  • 发布于 2020-06-15 15:03
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快速上手的中文版GSEA工具!

为了解决四个难题我们设计开发了“GSEA简易分析工具”和” GSEA结果可视化工具”

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  • 柚子
  • 发布于 2020-06-15 14:53
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