TCGA数据发表5分文章

5分TCGA文章的解读

小白也能画漂亮的热图--赐你一个非编程热图工具

文章投稿,除了文好当然还要“颜好”!在这个看脸的世界,为了给文章加分,各位老师学生也是做足功课了!但是不会编程敲代码?——那必须学学各种绘图小工具了。

用公共数据发文章-基因家族分析好思路

利用公共数据发文章,基因家族好思路。 虽然我们一直在说可以“用别人的数据,写自己的文章”,但是具体怎么操作,很多同学还是不清楚。今天就用一个完全用公共数据库资源进行分析发文的例子来和大家分享下这方面的思路。

加权基因共表达网络(WGCNA)寻找与疾病相关的hub基因

低成本发一篇sci,你也可以的!!!快来围观吧!

快速解读:3-5分的蛋白质组学文章思路

3-5分蛋白质组学文章思路!

DECenter:简便的差异分析工具使用教程

DECenter:简便的差异分析工具使用教程

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  • 发布于 2018-07-12 20:44
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简易数据标准化工具使用说明

简易数据标准化工具

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  • 发布于 2018-07-12 17:08
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便捷ID转换器-V3使用教程

便捷ID转换器-V3使用教程

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  • 发布于 2018-07-12 15:02
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GEO便捷转换器使用教程,帮你轻松处理GEO平台数据

GEO便捷转换器使用教程,帮你轻松处理GEO平台数据

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  • 发布于 2018-07-12 14:08
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桑格助手公众号使用攻略

推荐一个灰常灰常好用的微信服务号

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  • 发布于 2018-07-03 15:12
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五年生存率 三年生存率 该怎么计算?

在做生存分析的时候经常会有各种年份的生存率计算,比如手术的五年生存率,某种治疗方法的五年生存率等等,那么我们经常使用K-M法来制作生存曲线,看不同的样本之间的差异,在低分的杂志中五年生存率见得比较少,但在很多大文章中还是比较常见,那么五年生存率是怎么计算的呢

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  • 祝让飞
  • 发布于 2018-06-23 21:27
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蛋白质互作网络挖掘中Hub Genes该怎么选

    Hub基因通常都是具有代表性的一些基因,如何从众多基因集中找出它的真身呢?今天小编给大家介绍以下Cytoscape中的Cytohubba模块。     Cytohubba是Cytoscape软件用于识别hub节点的插件,那...

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  • 发布于 2018-06-20 11:10
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学R学系列-03-R,Git和Github(下)

R,Git和Github

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  • 文虎
  • 发布于 2018-06-15 21:15
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学R学系列-03-R,Git和Github(上)

R,Git和Github

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  • 文虎
  • 发布于 2018-06-15 21:12
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用GEO数据不做实验不用编程轻松发两三分的文章

    GEO是目前常用的数据库中收纳数据量最为全面的数据库之一,我们本次基于GEO数据开展一篇生信类型的文章,进行解读、复现、拓展三个方面的解析。     我们本次的总是就是PC端做生信,实现零...

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  • 发布于 2018-06-15 21:04
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蛋白互作网络挖掘,轻松获取关键网络模块

这一讲,主要讲解蛋白互作网络构建以及结果优化,那么同样也是我们本次GEO数据挖掘系列的最后一讲,从开始文件章解读到文章中的每一步的分析操作,我们都通过零编程来实现完成,这里避免大家在...

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  • 发布于 2018-06-15 20:44
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KEGG富集分析还可以这么美化

上一讲,讲解富集方法以及结果的可视化,那么这堂课为实战篇复现以下文章中的结果,并使用cytoscape美化可视化结果。 1、开始画面,一如既往的是操作步骤流程图 2、文章中KEGG结果部分解读...

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  • 发布于 2018-06-15 20:28
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做富集分析不一定非得用R,结果依然秀色可餐

    那么经过前面一系列的操作后,终于拿到我们需要的差异基因,下面就要开始这些差异基因的表演了,估计大家首先想到就是这些基因有一个什么功能,首选就是KEGG和GO富集分析,目前大家常用的是...

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  • 发布于 2018-06-15 20:11
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多套数据集我们分别筛完了差异该怎么去整合?

之前讲到通过DEcenter做差异分析,利用多套数据集都得到各自的差异基因,简单粗暴的可以通过Veen图的方法观察多套数据集中同时差异的基因,通过RRA算法简易实现工具来尝试更为合理整合方法。

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  • 发布于 2018-06-15 17:41
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手把手五分钟教会你如何做GESA富集分析

本节分析是文章中所没有提到的分析,作为我们文章外的拓展知识扩充进来,那么小编最近也是看到有些小伙伴也在问关于GESA的相关问题,那么这里就是给大家做出了演示以及怎么分析、结果怎么解读哦...

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  • 发布于 2018-06-15 17:10
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