祝让飞
祝让飞 - 生物信息工程师 生信一期

性别: 浙江 - 杭州 注册于 2017-03-25

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最近动态

13小时前 回答问题

便捷ID转换器可以帮你转化,你去看看

13小时前 回答问题

数值出入较大 你肯定是哪里下载错了,随访信息可能会有差别,转录组的 基本上不会有差异的

3天前 回答问题

OMIM的这个数据需要申请的,你需要注册,申请数据,然后才给下载链接

3天前 回答问题

是版本问题,没有转换出来的Symbol是因为目前这个Symbol还没有统一,在不同的数据库中名称不一样,所以 为了统一识别 工具对该类型的ENSG保留原貌,以便能寻根。

5天前 回答问题

你的这个截图可以看出 人家是用的配对 T检验,如果你和他用的是同一套数据的话,可能使用limma就筛不出来,大概率问题在于foldchange普遍比较小,你试试 使用1.5倍,或者1.3倍筛选

5天前 回答问题

食管癌 腺癌和鳞癌 好像不分,你下载临床随访信息 从发病部位看一下 哪些是鳞癌或腺癌

5天前 回答问题

FPKM和TPM都可以

5天前 回答问题

旧版使用的是biomart进行ID转换,得到编码基因共包含24000个(其中有一部分也是非编码的),而新版的使用的是gencode v22版本的gtf,根据里面的type=protein_coding进行提取的编码基因,其中不同的版本会相差一些基因的。

6天前 回答问题

看这里:https://shengxin.ren/article/439

2018-09-10 10:51 回答问题

使用 简易矩阵提取工具 可以帮你搞定,教程如下: https://shengxin.ren/article/420