13小时前 回答问题

便捷ID转换器可以帮你转化，你去看看

13小时前 回答问题

数值出入较大 你肯定是哪里下载错了，随访信息可能会有差别，转录组的 基本上不会有差异的

3天前 回答问题

OMIM的这个数据需要申请的，你需要注册，申请数据，然后才给下载链接

3天前 回答问题

是版本问题，没有转换出来的Symbol是因为目前这个Symbol还没有统一，在不同的数据库中名称不一样，所以 为了统一识别 工具对该类型的ENSG保留原貌，以便能寻根。

5天前 回答问题

你的这个截图可以看出 人家是用的配对 T检验，如果你和他用的是同一套数据的话，可能使用limma就筛不出来，大概率问题在于foldchange普遍比较小，你试试 使用1.5倍，或者1.3倍筛选

5天前 回答问题

食管癌 腺癌和鳞癌 好像不分，你下载临床随访信息 从发病部位看一下 哪些是鳞癌或腺癌

5天前 回答问题

FPKM和TPM都可以

5天前 回答问题

旧版使用的是biomart进行ID转换，得到编码基因共包含24000个（其中有一部分也是非编码的），而新版的使用的是gencode v22版本的gtf，根据里面的type=protein_coding进行提取的编码基因，其中不同的版本会相差一些基因的。

6天前 回答问题

看这里：https://shengxin.ren/article/439

2018-09-10 10:51 回答问题

使用 简易矩阵提取工具 可以帮你搞定，教程如下： https://shengxin.ren/article/420