RNAseq FPKM\TPM\Count相互转换及lncRNA提取工具
对于RNA-seq数据集，如TCGA RNA-seq，我们经常需要做一些转换，比如Count转FPKM 或者Count转TPM,或者FPKM转TPM,同时我们还经常需要从RNAseq数据中提取lncRNA,在这里我们开发了一个简易的工具，...
对于RNA-seq数据集，如TCGA RNA-seq，我们经常需要做一些转换，比如Count转FPKM 或者Count转TPM,或者FPKM转TPM,同时我们还经常需要从RNAseq数据中提取lncRNA,在这里我们开发了一个简易的工具，用以进行数据转换，该工具共有八个功能。
1、FPKM转TPM
2、Count转TPM ***需要GFF3文件*需要Ensembl ID的表达谱
3、Count转FPKM ***需要GFF3文件*需要Ensembl ID的表达谱
4、提取lncRNA表达谱 ***需要Ensembl ID的表达谱
5、提取蛋白编码基因表达谱 ***需要Ensembl ID的表达谱
6、提取假基因表达谱 ***需要Ensembl ID的表达谱
7、GeneSymbol ID转Ensembl ID
8、Ensembl ID转GeneSymbol ID
以上八个功能，均需要提供一个 行为基因，列为样本的 表达谱 作为输入数据，界面如下：
点击 开始分析-》弹出框-》输入 任务名称-》点击确定
耐心等待 呈现运行完成
载入结果之后，页面下方 会呈现运行日志：
右侧还有 写作指导
- 发表于 2021-08-19 10:47
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- 分类：软件工具
