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小白福音:TCGA突变瀑布图简易个性化绘制工具
oncoplot
TCGA瀑布图
突变景观
突变相关分析的时候我们经常会选择瀑布图进行展示,瀑布图看起来十分的复杂高端,TCGA数据库中提供了近30种肿瘤的外显子测序数据,在这里我们开发了一个 个性化的工具 可以快速的展示指定基因在...
看教程不够直观,那就看视频吧!
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突变相关分析的时候我们经常会选择瀑布图进行展示,瀑布图看起来十分的复杂高端,TCGA数据库中提供了近30种肿瘤的外显子测序数据,在这里我们开发了一个 个性化的工具 可以快速的展示指定基因在指定样本中的突变景观。
需求1、绘制某个肿瘤中的突变频次最高的前X个基因的突变景观
点击提交之后 展示图形:
需求2:指定绘制某些样本的突变频次最多的前X个基因的突变景观
点击提交:
需求3:指定某些基因在某些特定的样本中的突变景观
点击提交:
需求4:指定某些基因在某些特定的样本中的突变景观,并将这些基因进行分组
可视化如下:
需求5:指定某些基因在某些特定的样本中的突变景观,并将这些基因进行分组,并统计他们在不同样本组中的突变差异
可视化如下:
需求6:不仅仅有分组,还想对 基因或者样本进行 更多的注释
可视化如下:
需求8:当我们仅仅只想对 样本或者 基因进行分组,然后又想带多个注释信息,此时 我们可以将 分组列设成 只有一个值,这样就可以过滤掉分组了
可视化如下:
最后,在网页下方有绘图的描述:
发表于 2021-10-25 12:07
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分类:
软件工具
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