wwwblast已经不再更新啦，有没有比较好用的替代品呢？ViroBLAST帮你解决问题
不少人会有在自建内部使用的在线的BLAST的需求，NCBI也做了这样的东西叫wwwblast，
但是wwwblast已经很久没更新不说，连NCBI自己都放弃了，在NCBI的FTP站点上现在已经都找不到
下载链接了。ViroBLAST是华盛顿大学微生物学院开发出来的一款非常优秀的替代品。
首先说明ViroBLAST对于商用是需要收费购买License的，但是我们作为非盈利目的的自用的话
是可以免费使用的。有需要的同学请去点我
填写一个表单就可以获取一个免费的License然后就可以下载使用了。
部署安装也是非常简单的，下载了代码之后把代码拷贝到web server的根路径（比如apache的/var/www/html/），运行：
gzip -d viroblast.tar.gz
tar -xvpf viroblast.tar
第一命令很好理解就是按照gzip方式解压，第二个命令-x参数是解tar包，-v是verbose模式，
-f后面直接跟文件，那这个-p是啥意思呢？其实很简单，BLAST需要的索引文件是需要手动建立的，
那么怎么才能让所有人都可以建立索引呢？ViroBLAST已经data目录以及其他目录的权限都搞好了，
-p参数的意思就是权限不重新生成就按照压缩包里面的权限处理。这样就可以在浏览器访问啦（前提是你的web服务是没问题的，每个人环境都不同，这里不多写）。
这时你访问你的ViroBLAST就会发现blastn只有一个Nucleotide test database可供选择，blastp只有一个Protein test database可供选择。我如何新建我自己的BLAST索引呢？
以下以基因组GRCH38p2.fa为例:
第一步：把GRCH38p2.fa复制到ViroBLAST根目录下的db/nuleotide目录（蛋白序列复制到db/protein目录）
第二部：运行
blast+/bin/makeblastdb -in db/nucleotide/GRCH38p2.fa -dbtype nucl
这样你就可以在浏览器上看到GRCH啦！！！
