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为什么有文章直接用GEPIA数据库中的数据进行验证？比如若基因表...
你看看文章是不是先用其他数据做的，比如GEO中的数据。然后通过GEPIA使用TCGA的数据进行验证。就是使用多套数据集去验证你结果的鲁棒性
回答于 2020-09-09 10:51
请问大家有没有见过寻找随着肿瘤分期增加表达量递增或者递减的基...
Identification of Potential Crucial Genes and Key Pathways in Breast Cancer Using Bioinformatic Analysis
回答于 2020-09-09 10:49
求助！如何从GEO中lncRNA的芯片数据提取其中mRNA数据，并显示为g...
你可以看看刘小乐老师的这篇文章Integrative genomic analyses reveal clinically relevant long noncoding RNAs in human cancer，做的是从芯片数据中提取lncRNA表达，和你的要求相反，可以借鉴一下
回答于 2020-09-09 10:40
不同组织的样本可以分别筛选差异基因，然后再取交集进行后续分析...
看你后期怎么解释了，这些基因可能和房颤和脑卒相关，是否能以此找到在疾病发生发展过程中这俩疾病共同的失调通路或生物学过程。
回答于 2020-09-09 10:34
miRNA数据合并后有两个文件：miRNA Profiling.isoform.merge.cou...
我觉得是RPM，FPKM是对基因长度进行校正，miRNA都是二十几bp，长度校正没啥意义，平时我使用的时候直接是算RPM的，不知道你的数据是不是这样
回答于 2020-09-09 10:29
请问R语言如何实现这种图？
如果单纯是颜色不同的话，直接用col设置颜色就行了。 但要达到你上面这种大小还不一样的效果，我觉得可以先所有点都用第一种颜色和大小画上，然后第二种点用points直接在原图上再描点，选择更深，点大小更小的参数，第三种类似接着往上描点。试试可以吗
回答于 2019-11-23 10:48
根据基因名字提取基因表达情况。
setwd("d://data/") #假设文件在D盘data目录下，设置当前路径 data1<-read.table("data1.txt",header=T,stringsAsFactors=F) #假设左边矩阵为data1.txt data2<-read.table("data2.txt",header=T,stringsAsFactors=F)#假设右边矩阵为data2.txt index<-match(data2[,1],rownames(data1))#将右侧基因名与左侧表达...
回答于 2017-09-18 09:26