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15 个回答

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问下Gsea和go,kegg 优势在哪,写文章如何取舍

 GSEA是通盘考虑全部差异基因的作用,即使某个基因p值只有0.049,gsea也会考虑。go和kegg富集时,优先考虑p值显著的,对于p值0.0499的,程序会默认他们不重要。

回答于 2018-08-23 09:16

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goodSamplesGenes加载不成功如何解决(WGCNA)

1、尝试升级下R版本;2、用biocLite重新安装WGCNA包。

回答于 2018-08-23 09:16

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WGCNA在选择软阈值时出现这个问题是什么错误,该怎么解决?

这个是常见的情况,软阈值超过一定阈值之后不再符合冥分布,如果觉得看着不舒服,可以把13之后的部分给截掉,1:12,软阈值选择6就可以了

回答于 2018-07-24 08:02

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为什么sangerbox中的工具显示启动完成但没有反应?不弹出窗口。

这种情况 都是 没有安装好 java的原因,在升级 界面里配置一下java

回答于 2018-07-24 08:00

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我用ID小工具转化出来lncRNA没有样本数据呢?就是一行就是基因信...

没有表头 你需要在软件的右侧勾选 包含表头 这样就能导出表头了

回答于 2018-07-24 08:00

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WGCNA分析, 基因表达文件中,有2万个基因,如何进行选取?是根...

所以你想用WGCNA做什么呢?根据你的思路去选取 数据处理方法

回答于 2018-07-24 07:58

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工具盒一些工具能启动弹出窗口,一些显示启动但无工具窗口弹出

应该是你安装的那个java版本的问题,可以使用内置的java看看

回答于 2018-07-24 07:57

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GSEA分析全部基因集在高表达聚集

这种情况 建议你先做一下TPM,或者分位数标准化,如果还是这样 说明结果本身就是如此

回答于 2018-07-24 07:55

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TCGA 单个LncRNA 临床病理资料分析

这些 使用Excel配合小工具 就可以完成

回答于 2018-07-23 17:47

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DECenter运行后,显示结果到处了,但在文件夹里 找不到结果文件

看你的文件名称 很奇怪,这样的文件名称路径可能不识别,建议你换个正常点的文件名称

回答于 2018-07-23 08:48