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TCGA RNA Seq的R包分析选择?

老师请问什么是后续分析呢?第二条提到的“后续要继续分析的话用FPKM,我习惯先转成TPM”。 用counts通过DECenter得到差异表达的数据后,接下来打算做生存分析,火山图,热图,Go分析,KEGG分析。 这时应该在之前把FPKM用归一化中的TPM转换么?然后在开始差异分析,生存分析等等接下来的操作? 期待老师的解答,谢谢。

回答于 2019-01-09 00:21

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求一份TCGA简易下载工具或者下载链接

https://www.shengxin.ren/article/95

回答于 2018-01-20 09:14