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最近动态

5天前 回答问题

文件不对吧,你的这个里面给的是表达谱数据吗?

6天前 追加超级会员时间

2019-01-28 09:36 回答问题

数据处理顺序不对,1、TCGA下载工具下载合并数据;2、数据标准化工具转TPM;3、ID转换。如果先转换ID就无法转换TPM。

2019-01-24 21:30 追加超级会员时间

2019-01-24 21:30 追加超级会员时间

2019-01-22 09:19 回答问题

数据类型不对,edgR需要给的counts数据,最直接检验方法看下数据是否全为整数

2019-01-22 09:17 回答问题

换个网络试下,我这边测试没有问题

2019-01-21 11:56 回答问题

可以的,如果是TCGA数据也可以用简易标准化工具转成TPM,不是TCGA的数据这个就不能转了

2019-01-21 11:47 回答问题

edgR包自动处理counts数据,然后进行差异分析。 进行生存分析:1、TCGA数据可以直接下载FPKM;2、GEO数据可以从原始数据开始进行标准化RMA或者其他的方法;3、自己测的数据转成FPKM根据公式自己编写个程序。 也可以用工具盒里面的简易标准化工具

2019-01-21 11:34 回答问题

理论上来将是没有问题的,需要注意的就是gff3文件格式要跟教程一致,不然提取不出lncRNA