3 如何对肝癌数据做Fold Change

根据教程https://www.shengxin.ren/article/208,发现有很多不一样的地方。

【问题1】肝癌数据的下载可以跟胃癌一样么,肝癌数据的分析可以按胃癌教程走么?

(胃癌差异分析教程:https://www.shengxin.ren/article/209)


【问题2】同样的操作,我在小工具上得到的肝癌数目与教程不一样

教程有421条,而我只有371条:

attachments-2018-03-DdWkLJUy5abb115f0e22e.


【问题3】下载到的fileID.tmp还少了一列,只有两列。而教程有3列:

attachments-2018-03-9xpv3z6G5abb12563bf34.


不知道是哪里出错了,望各位大神走过路过瞧一瞧!


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1 个回答

strings

问题1:胃癌的数据做的是肿瘤患者的生存分析,你做的是癌与癌旁的差异表达。明显你多了癌旁,所以,该教程不适用。


问题2:教程中有癌旁(11),你没有选11。少一些是正常的。


问题3:可以看出第三列就是第二列去掉最后几个字符,自己用excel处理一下就好了。

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  • titi 提出于 2018-03-28 11:57

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