如何使用SRA数据

老师我想请问一下,如何使用SRA数据库中下载的数据?比如SRR032112.sra:

我想用这个数据来做预测,预测这个数据的类别(即cluster)

可我将sra数据转化为fasta后,看不出这个数据有哪些类别:

attachments-2018-05-fsMsSXeN5af000b0f3dc2.

而这篇论文还说这有这么多个类别:


attachments-2018-05-8b7WF1Sa5af000f6876dc.

Bao E, Jiang T, Kaloshian I, et al. SEED: efficient clustering of next-generation sequences.[J]. Bioinformatics, 2011, 27(18):2502-2509.

我不知道在哪里能看出,还请刘老师指教一下,谢谢啦!

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  • titi 提出于 2018-05-07 15:33

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