之前用GEO数据(GPL570平台)分析了一个肿瘤的差异mRNA和lncRNA。数据集是针对mRNA的，但是还是有少量的lncRNA，所以就一起分析了，然后审稿人质疑GPL570(Affymetrix HGU133 Plus 2)检测lncRNA的可靠性。芯片本身lncRNA的探针有1600+，最后筛选出的差异lncRNA就只有100多个(ಥ_ಥ)，然后询问是否可以转向使用TCGA数据，这样结果更令人信服。那我是不是就得用TCGA数据重新做?但是这样毕竟耗时间啊，改数据的话文章基本重做了，感觉改动好大啊。我不想改数据啊，大神们有没有中肯的建议?跪谢!