利用生信人工具下载TCGA肝癌数据有正常样本,但网站上TCGA数据库(https://portal.gdc.cancer.gov/)并没有看到正常样本的基因表达信息是怎么回事?

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1 个回答

omo - 登山爱好者

楼主问题解决了吗,我下载数据的时候也找不到正常样本...

刚刚我又去下载了一下数据,可以看一下购物车里的sample sheets文件,当我选的样本量比较多的时候,就会发现里面有些是11A同时也有对应的01A,我想TCGA官网上对于癌旁正常组织数据应该没有明确的下载地点,因为有的样本有癌旁样本数据,有的没有,所以应该是尽可能把筛选条件放宽。下载的时候除了cases 还有一个files选项,如果下载的数据中包含了正常样本,这两者的数目就会不同。

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  • 1874 提出于 2018-05-10 02:22

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