使用RMAExpress导出的数据第一列是探针?如何获得基因表达量?

使用最新的SangerBox中的RMAExpress工具,按照先导入cdf,再导入CEL格式的文件(GEO raw 数据下载后并解压缩后得到了CEL格式,这一步对吗?),进而以默认设置运行RMAExpress,过程中没有报错,最后Write Results to File (log scale)打开的矩阵第一列似乎是探针?

如何能够转换成基因表达水平的矩阵?(即类似于GEO便捷转换器输出的那种)

望解答,非常感谢!

我自己的初步想法是,是不是可以利用SangerBox中的ID转换器,以这个芯片的探针对应基因的注释文件(NCBI上下载的txt文件)为背景文件,进行转换,并且当多个探针对应1个基因时,取中位数,从而进行转换。

请问是这样吗?


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