5 WGCNA使用疑问
大家好，我是根据这篇文章在尝试计算一些工作：https://www.shengxin.ren/article/88
但是目前遇到了一些结果解释上的问题，因为附带的资料里并没有公式上的解读，所以在此请教。
①关于code：
# Recalculate MEs with color labels
MEs0 = moduleEigengenes(datExprFemale,moduleColorsFemale)$eigengenes
MEsFemale = orderMEs(MEs0)
这里计算MEs0得到的数据框怎么解读呢？Rhelp文件里写moduleEigenegenes是利用主成份分析的思想，
这个数据框是一个nxp的矩阵，n代表样本数，p代表色块（应该就是主成份吧），那这个矩阵里的每一个入值代表什么呢？正负又有什么意义呢？
我的部分值：
②关于图像
这个是我模拟做出来的一幅图，与作者附带的老鼠研究的图中有一个不同，就是负相关的第一幅图，我现在不知道该怎么解读了。
纵坐标里包含了每个基因的表达（跨样本）与感兴趣的协变量之间的相关性，这个我可以简单理解为，纵向的正相关表示表达上升，协变量（连续变量）上升，负相关表达上升，协变量下降吗？
横坐标有些不明白，主要是因为上面那句代码计算出的结果不太会解读。我自己的猜测是对于色块里每个基因与这个色块的关系度，那么正负又代表什么意思呢？与模块的什么正相关或者负相关？
那么横纵坐标放在一起又代表什么呢？
因为我的图像里可以看到第一幅图，从图像来看又是一个负相关，这个该怎么解读呢。
希望同行们可以给出一些解释，非常感谢。
另外如果有关于这个部分的公式解读那就更好了，因为文档里是这本书12节的介绍，主要是代码和基本的图像解读，有些确实是看不太懂。