Toggle navigation
首页
(current)
问答
文章
工具
视频
登录
注册
3
用TCGA小工具下载mRNA-seq表达数据,需要做批量生存分析和WGCNA,我看范例文章内都是下的FPKM,但我下载了FPKM数据,后期我又要做表达差异,需要用(DEseq)edgeR语言分析,又需要count数据,难道我还要再下载一次count数据吗?可以直接用DEseq工具分析FPKM数据吗?
TCGA
DECenter
差异分析
同时批量生存分析和WGCNA用mRNA-seq中FPKM,后期差异分析又要用count数据,要同时下载FPKM和count数据吗?
2 条评论
请先
登录
后评论
默认排序
时间排序
0 个回答
您需要登录后才可以回答问题,
登录
或者
注册
关注
2
关注
收藏
1
收藏,
6894
浏览
任美玲
提出于 2018-07-13 10:55
相似问题
TCGA临床数据中怎么区分癌和癌旁组织?
0 回答
请指导
0 回答
请问http://sangerbox.com/TcgaDown下载的数据是log化的,还是没有log化的?
1 回答
如何用R把TCGA 生存率里面days_to_death 这列数字变成T/F 0/1之类的状态形式
0 回答
网页下载好临床数据的xml文件后 怎么读取啊?
0 回答
TCGA下载的RNA-seq数据(TXT),如何根据JSON患者数据合并
0 回答
×
发送私信
发给:
内容: