3 用TCGA小工具下载mRNA-seq表达数据,需要做批量生存分析和WGCNA,我看范例文章内都是下的FPKM,但我下载了FPKM数据,后期我又要做表达差异,需要用(DEseq)edgeR语言分析,又需要count数据,难道我还要再下载一次count数据吗?可以直接用DEseq工具分析FPKM数据吗?

同时批量生存分析和WGCNA用mRNA-seq中FPKM,后期差异分析又要用count数据,要同时下载FPKM和count数据吗?

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