批量生存分析工具问题求助提交gene list 中只有一个基因做了分析

使用批量生存分析工具出现问题

我提交了200+的基因表达数据结果只出来一个基因的结果不知道问题出在哪里求教！！！

表达数据：

结果只出现了GAS2这一个基因

在https://shengxin.ren/question/419这个帖子里面找到了祝老师的回答！！可以参考！！

默认排序时间排序

2 个回答

铁银 - 医生 2018-08-18 20:03

TCGA中数据下载数据有三种形式：read count; FPKM; FPKM-UQ;做生存分析最好用FPKM

这个坑我之前踩过了

王国胜 2018-07-31 15:06

1、通过观察输入数据应该为count数据类型，只是统计比对到转录本上的计数，直接用于分析准确性较低；

2、将count数据转为FPKM或者下载FPKM的数据，从新进行分析

3、如果结果还是不理想，可以调整分组方式，如均值、分位数（两个调到50%即为中位数）