多个相同平台芯片原始数据RMA标准化后转换探针生成的表达矩阵无法应用boxplot绘图是怎么回事？

将4个同一平台先RMA标化后转换探针生成txt，用boxplot 绘制箱线图为何只有导出的txt ，没有图等pdf呢？看了一些帖子说Y值内不能有空格，好像没有空格，但是有很多///，是因为这个问题吗？刚才加载了violot包，也还是出不来图片

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3 个回答

liuzhe 2019-02-26 08:58

请把你的boxplot绘图代码黏贴一下

另外：我看到你的A///B的意思是基因名字或者叫作A，或者叫作B，这个不影响的，你可以只取基因A，然后表达值用后面的数值即可

杨懿 2019-05-04 08:29

请问问题解决了吗，我也出现这样的情况

好好学习 2020-03-13 16:02

这个问题，我在不同电脑安装的时候，也发现了，具体原因，与R语言包调用有关。

解决办法，打开R.exe

>install.packages("vioplot")

>install.packages("ggplot2") #这个也顺便装上把，以后画气泡图用的到。