5 如何用GPL文件将GEO芯片矩阵中的ID转换成gene symbol,用R语言。

## GPL10558 Illumina HumanHT-12 V4.0 expression beadchip
library(Biobase)
library(GEOquery)
#Download GPL file, put it in the current directory, and load it:
gpl <- getGEO(‘GPL8841′, destdir=”.”)
colnames(Table(gpl))
head(Table(gpl)[,c(1,4)]) ## you need to check this , which column do you need
ID2symbol=Table(gpl)[,c(1,4)]

得到了包含ID和symbol的文件,然后如何将GEO(GSE34472)芯片矩阵中的ID换成symbol呢?


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