高通量测序数据中，CpG甲基化谱的获取

我现在在GEO数据库中找到了些甲基化谱数据，但是他们给的是原始数据，不会处理啊。例GSE79277，我想得到每个CpG位点对应的表达谱数据，请问哪位大神有比较详细的处理流程

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Jason Y.J. Wei - 计算表观遗传学公众号 2017-10-15 09:30

就你给出的GEO数据集编号，你可以通过直接获取Series Matrix File(s)【这个可以在页面下方Download family中找到】来得到处理好的甲基化谱，不用自己处理原始数据，链接如下：
ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/series/GSE79nnn/GSE79277/matrix/

关于CpG位点对应的表达谱，一般情况下不是这样讲的，通常是把CpG位点先比对到基因上，然后去考虑基因的甲基化水平（启动子区域）和基因的表达水平。

高通量测序数据中，CpG甲基化谱的获取

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