甲基化芯片分析

GEO甲基化芯片,R软件分析的,可以分析出差异甲基化位点(113个),但是没有差异甲基化区域,如下图:这是什么原因?在进行芯片质量控制时MDS图如下:组内差异比较大时需删除相应的样本,这个MDS图怎样解读?谢谢attachments-2019-04-YLAiMRSE5ca5eeca94222.pngattachments-2019-04-KUNohnuG5ca5efad6fd46.png

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1 个回答

halei - 生信爱好者

条件严格,没有找到region?MDS来看研究群体结构是否一致,在大量数据下,样本应该聚在一起,没有分群现象。样本数据少可能会不明显。

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  • 江平 提出于 2019-04-05 07:55

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