20 希望您能解答一下“用小提琴图来可视化基因差异表达之美化过程”

您好,请问你的索引是怎么得出来的呢?“根据临床样本信息进行筛选即可”,是利用which函数吗?但我的数据中,对照和处理有交集,无法用大于某个数来筛选,想请教一下您,谢谢。

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1 个回答

GeMH - 生信分析工程师

其实博主“根据临床样本信息进行筛选” 的意思,就是拿到 不同样本类型(在他的例子中就是tumor/normal) 对应行的行号;

ex : tumor变量:3,4,6,7,9…… 就是说第3,4,6,7,9…… 行是tumor样本;

那么在你的数据集中,对照和处理样本应该是知道的吧。那么挨个拿出不同类型样本的基因表达量输入vioplot()就OK了  

至于你说的对照和处理有交集,虽然不清楚你怎么设计的会有交集,但vioplot() 也不会管你是不是有重复数据,如果不影响,就不用管

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  • lxx 提出于 2019-04-30 11:00

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