3 ensemblToSymbol.pl文件

本人生信新手,遇到Ensembl Gene ID转换成gene symbol ID时候需要一个ensemblToSymbol.pl文件,有哪位有吗?或者还有什么办法能够快速大量地完成转化,在此谢过各位的帮助了

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2 个回答

joanna

可以试试DAVIDhttps://david.ncifcrf.gov/

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panxiaoguang

去genecode 下载gtf文件,然后用python的gtfparse库去解析得到gene_id 和gene_name两列,然后使用python 的pandas库的join方法去合并你的id表和gtf解析后的表,得到的便是gene symbol

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  • 董戌晖 提出于 2019-06-24 19:03