您好,想请教一下Blast+ 本地比对时,Linux command line恰当的参数设置和格式输出
1、percent identity有必要设置吗?
2、我的Blastn命令如下
blastn -query HomoChr.fasta -db hbbNt -out hbbNt.blastn@nt.TabulrComment -evalue 1e-5 -word_size 20 -max_target_seqs 10 -penaty -2 -reward 1 -perc_identity 90 -num_threads 8 -outfmt "7 qacc sacc evalue qstart qend sstart send length pident bitscore mismatch gaps"
输出的结果table打开之后如下
首先每一列没有对应的表头,另外结果出现很多重复,如何修改命令可以 以下面的例子正确输出
如果可以的话,能加下您微信吗?