我在GEO数据库下载的MINiML格式文件进行数据转换,输出的基因ID选的是GeneBank编号,这需要是NCBI上一一比对出基因ID吗,对应样本的表达量值就是log2(FPKM)值吗,可以直接用来做热图分析基因的表达谱吗?
谢谢大神回复。
补充一下,文件里面没有基因名和基因symble,用GeneBank Acession导出来的数据比真实的基因ID少很多,是因为多个基因可能对应一个GeneBank Acession编号吗?
请问你解决了嘛 我也有这个问题