5 GEO数据标准化进行生存分析 已解决

attachments-2020-02-JORzsYxV5e4afea242121.png请问老师,用GEO数据进行生存分析时,得到的原始矩阵基因表达量单位为normalized log2 ratios(cy5/cy3)representing reference/test。这样的数据是否能直接用,需不需要再处理,如果要的话怎么处理合适呢?attachments-2020-02-sQd0sb9H5e4afea6b872b.png

进行分析后得到的几个基因HR和预期的是相反的(根据其他文献的经验),请问老师,是否和这个原始数据有关,是否其cy5/cy3通道的样本设置是反的?

非常感谢祝老师!


补充提问:是否只需取表达量负值进行分析就可呢,谢谢老师

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  • 提出于 2020-02-18 05:51

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