5 GEO数据标准化进行生存分析 已解决
请问老师，用GEO数据进行生存分析时，得到的原始矩阵基因表达量单位为normalized log2 ratios（cy5/cy3）representing reference/test。这样的数据是否能直接用，需不需要再处理，如果要的话怎么处理合适呢？
进行分析后得到的几个基因HR和预期的是相反的（根据其他文献的经验），请问老师，是否和这个原始数据有关，是否其cy5/cy3通道的样本设置是反的？
非常感谢祝老师！
补充提问：是否只需取表达量负值进行分析就可呢，谢谢老师