3 DEcenter运行出错

运用DEcenter分析TCGA数据,选用limma(芯片)方法分析可以得到结果,但选用edgR(counts数据)结果显示:ERROR : 无法分配大小为86.2 Mb的矢量 ,再选用DESeq2(counts数据)结果显示:Warning messages:

1: 程辑包'GenomicRanges'是用R版本3.4.2 来建造的 

2: 程辑包'GenomeInfoDb'是用R版本3.4.2 来建造的 

3: 程辑包'matrixStats'是用R版本3.4.4 来建造的 

ERROR : some values in assay are not integers 

希望各位老师能够帮忙。

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1 个回答

欢乐豆

目前sangbox小工具已经停止更新,请使用网页板小工具

小工具网址:http://sangerbox.com/Index 网站上会有在在线版的limma、edgR、DESeq2三个在线小工具

使用教程:请关注生信学霸微信公众号

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  • 李丁 提出于 2020-05-07 09:33

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