5 WGCNA筛选了方差前50%的基因,灰色模块还是很多是什么原因?

TCGA下载的FPKM数据,做WGCNA,不管是去除低表达基因还是用MAD或者方差取前50%,灰色模块都有很多基因,也调整过minModulesize=50,mergeCutheight=0.3,还是有很多灰色基因。。。请问可以怎么调整,还是说数据就这样没办法了?



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1 个回答

lu sen

你是不是用的SangerBox里面的WGCNA小工具?能用吗?我导入后得到的结果里面,表型总是“Random1”和“Random2”,样本信息里的表型根本就没有出现啊。

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  • lixj 提出于 2020-06-19 19:01

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