错误信息：b"Error in read.table(file = file, header = header, sep = sep, quote = quote, : \r\n 'row.names'\里不能有重复的名字Calls: read.csv -> read.table\r\n停止执行\r\n"，看来是行名有重复，你可以把你的文件发过来，我具体测试一下。
3 按照步骤，DEcenter显示错误，不知是哪里问题，请老师帮忙看看。
所使用的方法：limma(芯片） p值：0.05 fold change值：1.0 是否已经取过log值：是
样本类型列为：第4列 正在运行，请稍后... 是否正确运行：否
输出信息：无
错误信息：b"Error in read.table(file = file, header = header, sep = sep, quote = quote, : \r\n 'row.names'\xc0\xef\xb2\xbb\xc4\xdc\xd3\xd0\xd6\xd8\xb8\xb4\xb5\xc4\xc3\xfb\xd7\xd6\r\nCalls: read.csv -> read.table\r\n\xcd\xa3\xd6\xb9\xd6\xb4\xd0\xd0\r\n"
运行出错，请检查你的数据！
把文件名的中文全部换掉后，重新做了一次差异分析。
表达矩阵文件：E:/liling shengxin/bmp9/GSE40960_family.xml/chayi\Merge_GPL570.expro.txt
样本信息文件：E:/liling shengxin/bmp9/GSE40960_family.xml/chayi\SampleInfo.xls
输出路径：E:/liling shengxin/bmp9/GSE40960_family.xml/chayi
所使用的方法：limma(芯片）
p值：0.05
fold change值：1.0
是否已经取过log值：是
样本类型列为：第4列
正在运行，请稍后...
是否正确运行：否
输出信息：b'ERROR : \xce\xde\xb7\xa8\xb4\xf2\xbf\xaa\xc1\xb4\xbd\xe1 \r\n'
错误信息：b'Warning message:\r\nIn file(file, ifelse(append, "a", "w")) :\r\n \xce\xde\xb7\xa8\xb4\xf2\xbf\xaa\xce\xc4\xbc\xfe\'5 ng/ml human recombinant BMP9 for 24hrs;-vs-none (control);.limma.txt\': No such file or directory\r\n'
运行出错，请检查你的数据！
