请问各位大神，我从GEO上下载了两个数据集，一个是组织样本的表达矩阵，一个是细胞实验的表达矩阵，这两个矩阵可以合并分析吗？
应该不可以，首先这两个数据集平台是否相同，不相同肯定有批次效应；其次组织和细胞的样本差异还是很大的，不建议整合分析
