3 GEO数据集对LncRNA重注释却未得到目标LncRNA

解决目标:获得目标LncRNA的表达量,以验证TCGA所建立的预后模型

目前采用方法:通过对探针进行重注释,以期能够完成对LncRNA的重注释。但贵网站所提供的教程都是以Affymetrix公司为例的,其可以轻松获得FASTA文件。我想用的GEO数据集则采用的是Illumina公司的探针芯片,无法获得该类型的文件。而本人采用个人方法均无法获得TCGA所获得的预后相关LncRNA数据,查阅其他人所发表文章则成功在GEO数据集中获取了一系列LncRNA数据,我得到的LncRNA重注释样本同样无法完全覆盖这篇文章中的相关LncRNA。

请问应该怎么办?

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