DECENTER运行出错的问题

错误信息:b"Error in read.table(file = file, header = header, sep = sep, quote = quote, : \r\n 'row.names'\xc0\xef\xb2\xbb\xc4\xdc\xd3\xd0\xd6\xd8\xb8\xb4\xb5\xc4\xc3\xfb\xd7\xd6\r\nCalls: read.csv -> read.table\r\n\xcd\xa3\xd6\xb9\xd6\xb4\xd0\xd0\r\n"


我准备分析的是TCGA RNA数据,生成矩阵,样本信息为手动编排的癌和正常,错误信息如上,请各位老师指教

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1 个回答

deepxin - 生物信息软件开发工程师

"Error in read.table(file = file, header = header, sep = sep, quote = quote, : \r\n 'row.names'里不能有重复的名字\r\nCalls: read.csv -> read.table\r\n停止执行\r\n"

你检查一下你的输入数据里第一列里是否有重复的,如果你使用的是第一个版本的DEC,结果保存目录和你的表达谱文件目录是同一个的话就会出现你上述的问题,你的表达谱文件就不能用了,建议换最新版。

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