GEO数据分析问题

您好,非常高兴有机会向您请教,麻烦看到后可以给我解答疑问。

之前订购了你们499的GEO数据分析课。也做了一些。现在发现一点问题,始终搞不明白。

我下载了GEO数据后如果芯片数据没有经过标准化,就是有的数据上百,上千,数据间大小差异大。那么我利用sangerbox进行差异分析的时候,是直接四分位数标准化后进行差异分析。还是经过log2标准化,再进行四份位数标准化后进行差异分析呢。因为经常发现三个芯片数据,有一两个下载后是标准化过的,直接四分位数标准化进行差异分析就行了。其他的就是没有标准化,不知道怎么弄。

cunzhe1211@163.com

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  • cunzhe1211 提出于 2021-03-08 11:53

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