GEO数据标准化问题

您好，非常高兴有机会向您请教，麻烦看到后可以给我解答疑问。

之前订购了你们499的GEO数据分析课。也做了一些。现在发现一点问题，始终搞不明白。

我下载了GEO数据后如果芯片数据没有经过标准化，就是有的数据上百，上千，数据间大小差异大。那么我利用sangerbox进行差异分析的时候，是直接四分位数标准化后进行差异分析。还是经过log2标准化，再进行四份位数标准化后进行差异分析呢。因为经常发现三个芯片数据，有一两个下载后是标准化过的，直接四分位数标准化进行差异分析就行了。其他的就是没有标准化，不知道怎么弄。