请问：您有统计基因组序列信息的脚本吗？比如得到它的n50， gc含量，覆盖度等，谢谢

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2 个回答

张海伦 - 生物信息分析员 2017-10-27 15:01

你好，首先感谢邀请。

这个处理基因组序列的脚本，是perl R还是python 呢。

这个N50 GC含量还是挺好做的。GC含量生信人的小工具就可以做。

这个覆盖度，就得需要通过read和基因组去比对获取吧。

这个脚本就麻烦了。

如果有定制化需求，可以找我，定制化开发。

祝好。

刘永鑫 - 工程师 2017-10-28 09:53

如果是自己分析的，基本信息软件都会提供的，如soap denovo，如果自己不够专业，基因拼接水很深，需要根据物种特征制定策略，建议还是找专业人士，比如楼上。