请问:您有统计基因组序列信息的脚本吗?比如得到它的n50, gc含量,覆盖度等,谢谢

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2 个回答

张海伦 - 生物信息分析员

你好,首先感谢邀请。

这个处理基因组序列的脚本,是perl R还是python 呢。

这个N50 GC含量还是挺好做的。GC含量生信人的小工具就可以做。

这个覆盖度,就得需要通过read和基因组去比对获取吧。

这个脚本就麻烦了。

如果有定制化需求,可以找我,定制化开发。

祝好。

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刘永鑫 - 工程师

如果是自己分析的,基本信息软件都会提供的,如soap denovo,如果自己不够专业,基因拼接水很深,需要根据物种特征制定策略,建议还是找专业人士,比如楼上。

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  • 小范 提出于 2017-10-27 14:36

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