TCGA数据下载之后的处理问题

之前群里的大师给回复说,TCGA简易下载软件下载的RNA数据合并并且转换之后并未做log处理,我想了解一下,合并之后的数据是需要做quantile normalize log2么?这个怎么来做?因为不会R语言这套东西,所以想了解一下有没有Excel解决这个的方法呢?

第二个问题,对数据进行log处理之后应该要进行Z评分,网上查到说是用原始数据减掉均值再除以标准差,同样是想了解,Excel套用这个公式去做,可以么?

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2 个回答

张海伦 - 生物信息分析员

需要做quantile normalize log2。这个用excel,你看看能不能用公式来处理,这个主要看数据量大小吧。

如果以后你经常性的处理这些数据,建议还是需要学习下R,python等相关的编程语言。这样处理起来方便。


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kingsire - 学生

合并之后的数据量并不是很大,后续的用Excel可以做的。

不过同意楼上说法,如果需要经常处理这样的数据最好还是学一下编程语言。

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