3 GEO芯片数据无法导出数据矩阵

我下载了https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE85008 里面的数据,下载格式是高亮处

attachments-2018-01-PEFX5WhH5a5d8181395eb.png导入GEO芯片数据显示如下

attachments-2018-01-NG7FPrDN5a5d81c4b5243.png跟教程里面比起来,蓝色方框内并没有数据

可以导出样本信息,但是没有办法导出数据矩阵,想请问一下大家是下载的数据本身就不用这个程序导出吗



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3 个回答

赵敏

您好,问题是这样的,您下载的是Illuminate平台的二代测序数据,而这个工具是针对芯片数据转换,你可以在GEO上下载芯片数据尝试一下attachments-2018-01-xnGMOLCH5a5ff913a165c.png

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王诗翔 - 研究生在读

关于你看的教程我不太清楚,但Series Matrix files 是矩阵文件(即数据),其他两个是注释文件(Soft 和 Miniml)。

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邾国庆 - 医学研究人员

意思是illuminate平台的数据不能用这个软件处理吗?那illuminate的数据要怎么处理呢,求指导

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