10 TCGA生存分析时合并临床数据有问题?

学习网站上的教程 https://www.shengxin.ren/article/209 用TCGA数据做生存分析,但是目前用的是V9版本,界面没有ClinicalFull按钮,也没找到替代的,我就点了合并,确实导出了一个文件,不知道这一步是不是有问题,所以导致了后面的问题?

如下图,是我合并后的临床数据

attachments-2018-01-viWqFFHa5a6da687f1a6c. 但是其中有两个days to death 和days to last followup  我把这几列复制出来了,如下。

attachments-2018-01-VTC30ML65a6da71ac7158.有些困惑,所以去GDC核对了下信息。下面是标红的一些患者信息。

attachments-2018-01-bnEBFaSQ5a6da7795758a.attachments-2018-01-DI0p99SB5a6da7ac03a0a.attachments-2018-01-p30YDzKy5a6da7fa39397.个人理解是,在我合并的文件中,死亡或者随访时间,应该是那两个days to death或者days to follow up的综合,一些患者登记后还没有来得及随访一次就死亡,记录在前面,而记录在后面的数据是有过随访,在随访中死亡或者继续存活的?

那么是不是我合并过程出错了呢?如果是的话,在V9里应该怎么操作?如果不是的话怎么处理?谢谢。



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  • SHI 提出于 2018-01-28 18:46