在ucsc下载的tcga数据库，怎样简单的用excel做癌组织与正常组织的转录组差异表达分析

比如我下载了brest invasive cancer,里面的BRCA geen expression (IlluminaHiseq)文件，用excel做某个基因在癌组织相对于正常组织表达量上升或降低百分比，有具体详细的步骤做法教程吗，完全是个生信的小白，求大神帮忙

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1 个回答

张海伦 - 生物信息分析员 2017-06-22 16:16

这个可以用fold change或者t-test去做。

这一步只是筛选差异基因，还好说。后面关于富集分析，表达网络构建就复杂啦啦。

你研究下，然后根据p值筛选。另外生信人这边有很多的案例，如果有需要可以私信邮箱给我。我发给你，做参考。