以前用老版的小工具下载的RNA-Seq数据经过ID转换后得到24992个基因,,,现在用生信人盒子经过ID转换后,得到19754个基因symbol(ID转换时我选的是编码基因),选择非编码RNA经过ID转换得到的是ENSGXXXXX格式的名字。 原来的24992...
我用TCGA简易下载工具,一点检索,就出现以下错误。求问该怎么解决?
http://sangerbox.com/TcgaDown 在这个网站,按照祝老师的方法显示开始下载,但一直找不到数据。求助u,谢谢!
TCGA下载的数据能用于sanger box工具里的GESA分析吗?我按 该网页 https://shengxin.ren/article/171 的步骤,点了批量运行后保存文件没反应,保存目录也没有任何文件生成,麻烦老师解答,谢谢!
大神请问一下。TCGA的miRNA(isoform)数据都没有标5p和3p,只看到了-1 -2或者a b,难道是这个代表3p 5p?
如图:
用下载工具下载的临床信息,有个A1_OS,还有一个last time to follow up,究竟哪个是总生存期,为什么官网没有A1_OS的数据?
v1.0.9版本提示本地无法连接TCGA数据库