TCGA中下载的转录组数据包含多种RNA,其中包含mRNA和miRNA,该如何区分不同的RNA,同时提取mRNA的数据呢,新手,还望多多指教下!多谢
想从下载工具里获得TCGA中的RNA表达数据,在可下载资源列表里给出的选项RNA-seq有好几种,应该选哪种数据进行分析?后续用于差异基因分析和生存分析的 有counts.,FPKM-UQ, FPKM
我通过生信人小工具下载了TCGA乳腺癌的详细临床数据,在查看其中的临床病理信息中发现,免疫组化指标有好几列数据,而且部分样本的免疫组化指标的阴性和阳性有时会冲突,特别是HER的免疫组化,FISH检测,还有一列叫做HER2...
就通过如图的FPKM表(一个正常一个肿瘤)做癌症预测分析(列是样本,行是基因),想请问下这样做的原理是什么?就为什么这样可以进行预测?有懂愿意详细答疑的也可以有偿答疑,谢谢
怎么从TCGA下载的数据中提取lncRNA的信息?求详细步骤,恳请大侠指点详细步骤
各位大佬,你们好,我用SangerBox下载TCGA某种肿瘤的转录本数据合并后,发现样本ID并不是那种标准的好几段,好像有几处字段缺失,所以无法区分癌症和癌旁组织,请问大家是如何区分的?下载后如上图 和这有些不同
登录不上这是为什么呢,求大神指教谢谢
tcga的数据,好多基因表达为0,是否做分析的时候应该都删除这些基因?还是在三分之一以上标本基因表达为0的要删除?谢谢。
用Singerbox下载TCGA数据时,用家里的网络下载几乎是不可能的任务,下三个就报错。只能在单位里下,这是为什么。
TCGA甲基化数据中最后一列是什么意思呀