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TCGA基因表达(HTSeq-FPKM)的样本名称和临床资料(Clinical merge)的样本名称不一样,如何对应?

我下载TCGA基因表达(HTSeq-FPKM)数据和临床资料(Clinical merge)数据,最后想挑选部分样本行生存分析,发现表达数据的样本名称是“TCGA-DB-A4XH-01”这种形式(图2),但是临床数据的样本名称又是“TCGA-75-5147”这种格式(图1)...

TCGA数据库分析某个基因在癌症和癌旁组织的表达差异

老师,您好,初涉这一块的小白,想做一个这种图找网上教程没有找到那种系统性的,想求助您有没有教程或者该怎么去学,打扰您了。

请问如何从TCGA下载小工具里下载microarray的数据,不是RNA-seq?谢谢

TCGA数据有不同时间版本号,生信人工具下载的是最2016新版本的吗

TCGA里面下载了LGG和GBM,从哪里能找到相对应的正常脑组织对照?

怎么用生信人工具下载鼻咽癌的TCGA数据?我该选择什么数据类型

请问利用TCGA的数据求两个基因的相关系数,应该用FPKM还是应该用TPM呢?

解决 tcga中counts数据用id转换小工具解析后没有circ-rna数据

请问TCGA中的level1数据和level3数据的样本数量是否一致?十分感谢

请问Sanger box里下载的基因表达和临床数据是从TCGA官网下载的吗?

你好,请问,在Sanger中打开TCGA数据库下载界面,为什么在TCGA数据类型筛选处的下拉按钮中没有任何东西,还有要输入GSE编号,这是什么啊

TCGA小工具安装v8的时候提示这个错误,有什么解决办法吗?

双击main.exe之后,提示这个错误,有什么解决办法吗?本人电脑是win7 ,64位的。我想用的是CNV的数据对应样本,貌似只有V8可以,在main.exe.log中改什么能正常使用呢?

TCGA胃癌生存分析点批量运行后,结果为啥一直出不来(已把缺失值删除)

已计算结果一直卡2585 已解决:运行的时候把工具盒这个软件界面给关掉就好了

TCGA批量生存分析工具如何将所有基因生存曲线批量导出到PDF文件里

 这个批量生存分析工具结果只能挨个点击想看的基因的曲线图,有没有一次性导出所有基因曲线图的功能?

如何用TCGA下载小工具merge以后得到RPKM而不是counts的合并数据?

真的小工具下载下来的mRNA合并,如何得到RPKM的合并数据而不是counts的合并数据?