请问，TCGA标准化化后的反相蛋白质阵列基因芯片( RPPA)数据如何下载？

 请问，TCGA标准化化后的反相蛋白质阵列基因芯片( RPPA)数据如何下载？用生信盒子可以么

用TCGA下载二代测序的序列的话，是个什么流程呀？从下载到选择什么样的文件分析，有没有相关TCGA使用以及分析数据的书籍推荐，谢谢！

以前从来没有接触过数据库之类的科研小白，还希望大牛们不吝赐教！

使用小工具下载数据，为什么没有TCGA-BLCA这个癌种的数据

1.我在我的小工具上没有找到TCGA-BLCA（膀胱尿路上皮癌）这个癌种的数据，请问大佬这个癌种不能通过小工具下载吗？目前我的小工具是v16版本。

解决 用简易TCGA下载工具，clinicalFull出错，显示“合并提取所有临床随访信息出现错误，请检查文件”

这种错误怎么处理啊？求助，感谢

TCGA简易下载工具V16中的临床随访信息中各项如何解释？

老师，V16版中的临床随访信息，比如像NEW EVENT和NEW EVENT TIME，在购买您的临床信息解释中没有找到具体对应项，请问有V16版的临床解释吗？

简易TCGA下载工具，运行报错

raceback (most recent call last):   File "Main.py", line 21, in   File "com\sxr\utils\FileOpertor.pyc", line 11, in   File "xmlrpclib.pyc", line 145, in   File "httplib.pyc", line 80, in   File "mimetools.pyc", line 6, in   File "tempfile.pyc", line 35, in   File "random.pyc", li...

tcga下载后的文件进行edger和heatmaps分析

老师您好，从小工具下载了 merge_matrix. txt文件merge_matrix. txt.cv文件，clinical full.matrix.txt文件。之后进行edger分析。请问是用第一个文件么? 运行时显示各种找不到对象，是因为merge_matrix. txt文件打开excel后的表头等参数和找的代码...

GTEX与TCGA数据移除批次效应时，出现报错，请问这是什么原因导致的？

按照相关网站的说明对GTEX与TCGA的数据进行整理后进行了标准化处理然后合并在一起去批次，但是中途报错了，排除了数据缺失或者是数据全部为0报错的可能性，请问这个可能是什么原因导致的？有什么解决的方法吗？

信息更新

您好，在其他问题留言中我看到您提到TCGA临床信息最近更新了，请问那现在从生信人下载的TCGA数据是最新的么？非常感谢

TCGA CNV数据中的sample 标号跟 患者信息中的BARCODE 怎么对应啊，求大神赐教。

请问TCGA简易下载工具可以下载临床全部变量的数据吗？找不到，只看到clinical简约版

生信人V8下载的TCGA中的DNA甲基化数据就可以直接放到QDMR中分析吗！

TCGA数据下载，合并，ID转换后，要用什么软件分析癌和癌旁基因表达差异呢？

我使用的是TCGA的数据矩阵，为什么数据标准化工具里不能使用TPM转换？

如何在TCGA数据库中下载乳腺癌或宫颈癌的芯片的基因表达数据，谢谢