用下载工具下载的临床信息，有个A1_OS，还有一个last time to follow up，究竟哪个是总生存期，为什么官网没有A1_OS的数据？
TCGA GDC 进不去怎么办 ？ 换了几个浏览器也没用
下载了很久，但是一直处于正在检索，请耐心等待，然后下面那个框里一直是None.
请问TCGA下载工具下载的是RNASeq的数据还是RNASeqV2的数据？
就是在检索的过程中，软件一直提示正在检索，请耐心等待。。。
今天新安装了1.0.8版本的软件，确定JAVA和R后，发现启动TCGA不能弹出相应操作界面。删除后重新安装了1.0.9，并重新下载外源R包、同步R包后，发现还是不能用。肿么破？
TCGA的HTseq和GTEx的RSEM好像是不同的组装方法，他们可以拿来直接做比较吗
1、下载raw counts或者FPKM数据，有一些表达很低的基因需要过滤掉，一般有哪些常见的过滤标准呢？EdgeR有没有自带的过滤数据函数？ 2、在计算基因表达相关系数和做散点图和拟合直线的时候，数值为0的需要特别处理吗？
已经下载整理好一份基因表达表和一份临床信息表，但不知道怎样结合起来做生存分析
请问各位老师，tcga数据里的吸烟史和生育史在哪里?小工具下载完找不到
...呢。 2、我用CBIOPOTRAL下载的临床信息和这个软件识别的TCGA的信息一样吗？？？ 3、怎么把表达值和临床结合呢，。。一个一个找对应的样品名很麻烦，不知道有没有相应的小工具呢！！1 谢谢！！！！
TCGA下载肝癌counts数据，没有fileID.tmp文件，只有downxxxxxxxx.log文件，而且该文件无法按照正常的格式导入Excel，所以不能够合并文件。 我是按照https://www.shengxin.ren/article/208该网址教程进行处理的。 请高手赐教！
CNV文件名中， .nocnv "nocnv" just means that germline CN variations are removed. 所以我如果想看癌症组织中哪些基因是缺失或者变多了，是只需要看 带 .nocnv的吗？然后做个注释，看这个基因在整体中缺失或者变多的频率吗？