最近在做TCGA数据库的数据挖掘,想请问一下,TCGA的临床信息中哪里能找到肿瘤临床分期信息(也就是grade分期)?谢谢
今天发现TCGA简易下载工具有个问题,里面也可以收到GEO数据库的文件,可以合并文件,但是如果下载TCGA数据库的文件合并临床信息的时候均无法合并成功,一直显示正在合并,而实际文本大小为0kb.
简易TCGA下载工具下载AML数据,有187个RNA-seq样本,但是同时下载的临床数据有一千多个信息,如何将两者对应起来?
终于TCGA数据下载的终结版上线了,下载地址如:http://vip.sangerbox.com 界面沿用了之前的风格,一张图秒懂: 每种数据类型下载到个人中心后可以看到 合并的数据 和 单个的原始TCGA下载下来的数据,以肝癌FPKM数据下载为例: ...
您好!求tcga10版本下载地址。万分感谢
请教各位老师,用TCGA数据做生存分析,我们通常是用某个评分或者某个基因的表达量水平,来分析其与生存的相关性。但是每个病人受到的治疗不同,这个也会影响生存。即使在有些文献中做多因素COX分析,也是排除例如年龄...
你好,我用TCGA下载建议工具,不管用了。 一直不显示具体信息,之前不是这这个样子的
我对比了TCGA与GEO数据,TCGA我用的是FPKM,比如数据有0.01,也有1,有10,但是GEO 标准化后基本在0到20之间,这基因间的倍数就不一致,那我用TCGA建立的预测风险值COX回归模型的系数肯定不适用于GEO啊,请问是我思路错了还是方法...
从TCGA官网下载DNA甲基化数据大小几十G,从firehose网站下载只有100多M,为什么数据差异这么大?
您好,TCGA小工具能下载的临床数据是简化版的?如何能下载到完整的临床数据?谢谢